医疗污水处理设备的处理工艺是消.毒灭.菌后便可排入城市污水，然后进入城市污水处理场，进行深度处理。
　　由于医疗污水的来源及成分复杂，含有致病性微生物、有毒有害的物理化学污染物等，具有空间污染、急性感染和潜伏性感染等特征，不经有效处理会成为一条疫病分散的重要途径。
　　医疗污水的主要成分有：
　　1、医疗污水受到粪便、感染性细.菌和病毒等病原性微生物污染，具有感染性，能够诱发疾病或造成损伤。
　　2、医疗污水中含有酸、碱、悬浮固体、动植物油等有毒、有害物质。
　　3、牙科治.疗、洗印和化验等过程产生污水含有重金属、消.毒剂、有机溶剂等，部分具有致癌、致畸或致突变性，损害人体健康并对医疗污水处理设备的处理办法和工艺流程是根据处理目标而确认的，处理目标有悬浮物、飘浮物、有机物、放射性同位素、病菌、病毒、酸碱等。其间损害较大的是病原体。
　　值得注意的是：
　　医疗污水处理设备处理的污水中不能含有大块的固体物质,避免堵塞管道与孔口和水泵损坏；污水设备人孔有必要盖好，以防发生意外或掉入大块固体物质。
　　含病原体的污水应当经过消.毒处理；符合有关标准后，方可排放。医疗卫生机构产生的污水、传染病病人或者疑似传染病病人的排泄物，应当按照相关规定严格消.毒；达到有关规定的排放标准后，方可排入污水处理系统。
　　按照规定，医院的各种特殊排水，如含重金属废水等应单独收集，分别采取不同的预处理措施后排入医院污水处理系统。
　　传染病医疗机构和综合医疗机构的传染病房应设化粪池，收集经消.毒处理后的粪便排泄物等传染性废物。医疗机构的各种特殊排水应单独收集并进行处理后，再排入医院污水处理站。如检验室废水应根据使用化学品的性质单独收集，单独处理。
　　医疗污水处理设备采用了前置过滤和智能操控的运行方式，在国内中小型医疗污水处理技术上处于较高的地位，这种设备采用投药的消.毒模式，让医疗污水处理更加合理，更加符合有关要求。经污水处理设备消.毒处理后的污水达到相关标准，使医疗污水达标排放，消灭传染源，更加有利于环境。